Es muy fácil equivocarse entre el botón de eliminar líneas y de eliminar superior (albaran, oferta, pedido, etc.) Debería pedirte DOBLE confirmación. Ya que el protocolo de uso es el mismo para líneas que para documentos completos y la gente al uso no suele leer el primer mensaje y automáticamente le dan a sí para borrar. Sería interesante que en el documento al completo volviese a preguntar, ¿Estás seguro? SÍ / NO con los botones cambiados para reforzar la seguridad.
No es la primera ni la ultima vez que un usuario elimina un albarán o una oferta o pedido que aún no se ha facturado, sin darse cuenta pensando en eliminar una línea.